成立于2001年，受科技部合作司直接领导，负责"国际科技合作计划"的日常管理工作。"国际科技合作计划"是科技部在十五期间顺应国际科技发展趋势而设立的，旨在围绕国家科技发展战略，建立高层次、高水平的对外科技合作平台，以充分利用国际科技资源，增强我国科技自主创新能力，努力为国家经济建设和社会发展服务，为国家科技发展和建设中国特色国家创新体系服务，为国家的总体外交服务。
　　"国际科技合作计划"配合国家外交战略，有选择地资助一批政府间科技合作协定中的重点项目，以及一批有效利用全球科技资源，着力解决制约我国社会、经济、科技发展的重大科学问题和关键技术瓶颈，有利于实现"重点跨越"的重大国际科技合作项目。
　　计划办按照国家科技计划项目管理有关规定和要求，建立了一套自主知识产权的网络化项目管理平台"国际科技合作计划管理系统"，实行计划管理全程网络化，并在系统内集成了国际科技合作计划专家库（包含同行评议专家库和国际科技合作管理专家库，涉及 40个学科500个专业方向的4000多位专家）、 项目库 、 成果库及管理信息库等，为"国际科技合作计划"提供了丰富的高层次人才储备和强有力的技术支撑。
　　自2001年"国际科技合作计划"实施以来，计划办承担了大量的日常事务工作，包括承建网络管理系统、受理项目申请、组织项目评审、组织项目验收、收集项目成果、编纂计划年报、定期印发工作简报等。
　　同时，除"国际科技合作计划"管理工作外，计划办还承办双边、多边政府间科技合作协定备选项目的评审工作。迄今为止，计划办受科技部合作司委托，利用"国际科技合作计划管理系统"这一项目管理网络平台，已顺利完成了中葡、中斯、中希、中西、中澳、中日等双边、多边政府间科技合作预备项目的评审工作。

　　伴随着经济全球化进程的不断发展，科学技术的国际化趋势不断加强，科学技术进入了一个只有通过国际合作才能全面发展的时代。国际科技合作与交流已突破了原有的模式，从单一的纯学术交流到技术合作进而深入到经济领域，科技合作与经济合作日益融为一个不可分割的整体。在这种趋势下，科学技术资源（人才、资金、自然资源、基础设施和信息等）的国际市场正在逐步形成，获取和利用全球科技资源来促进本国的科技发展，以更低的成本、更高的效率获得更强大的竞争力，成为各国科技政策的既定方针。党的十六大提出：“在更大范围、更广领域、更高层次上参与国际经济技术合作和竞争，拓展经济发展空间，全面提高对外开放水平”。在当前经济全球化深入发展的新形势下，大力促进我国的国际科技合作事业，广泛有效利用全球科技资源，增强我国自主创新能力，提高国家科技竞争力，扩大我国国际战略资源、能源、技术利用和分享权益，是时代的要求，是历史赋予的使命，是国家发展的需要。
　　国家国际科技合作计划是国家层面上首个，也是唯一的旨在通过整合、统筹，充分利用全球科技资源，提高自主创新能力的对外国际科技合作与交流平台。“国家国际科技合作计划”作为国家科技计划体系中一个必不可少的组成，立足国民经济、社会发展和国家安全的重大需求，在国家层面上，汇聚和综合国家（包括部门和地方）各大科技计划中需要国际合作和可以对外开放的项目，统一对外开放与合作口径，全面吸引和充分利用国际科技资源，增强我国自主创新能力和提高国际竞争力，努力为国家经济建设和社会发展服务，为国家科技发展和建设中国特色国家创新体系服务，为国家的总体外交目标服务。
　　国际科技合作是我国科技工作和外交工作的重要组成部分。实施“国家国际科技合作计划”是落实我国国际科技合作战略，充分利用全球科技资源，解决科技、经济、社会发展中的重大瓶颈难题，在重点领域实现跨越式发展,提高我国自主创新能力的客观需求；是扩大我国国际战略资源、能源、技术利用和分享权益，实现新时期国家发展目标的有效手段；是落实政府间科技合作协定，推进双边、多边政治、经济、技术谈判和磋商，实现国家外交战略的重要保障。
　　一、定位
　　“国家国际科技合作计划”是国家科技发展计划体系的重要组成部分；是在开放环境下开展以我为主国际科技合作，充分利用全球科技资源，实现跨越式发展的有效手段；是推动双边、多边政府间科技合作，为国家科技、经济社会发展和总体外交服务的重要平台；是促进跨部门、跨地区对外科技合作统筹协调，增强自主创新能力、推进自主创新体系建设的重要举措。
　　二、指导思想
　　“国家国际科技合作计划”应立足《规划纲要》实施中的重大合作需求，以“自主创新，重点跨越，支撑发展，引领未来”的方针为指引，以增强国家科技自主创新能力、提高国家科技竞争力为中心，树立全球战略意识，凝练合作重点，加强统筹协调，提升合作层次，充分利用全球科技资源，为贯彻落实《规划纲要》的各项任务、增强我国科技自主创新能力提供有力支撑。
　　“国家国际科技合作计划”应促进国际科技合作的管理创新，加强统筹和协调，强化计划的政府引导功能，充分发挥国际科技合作各主体（特别是企业）的重要作用，进一步整合资源，提高效率，创造良好国际科技合作环境和条件，为实施“走出去”战略服务，坚持“引进来”和“走出去”相结合，坚持“项目-基地-人才-资源”相结合，坚持“引进-消化-吸收-创新”相结合。
　　三、基本原则
　　1．以我为主，双赢互利；
　　2．为我所用，支撑创新；
　　3．政府引导，多方参与；
　　4．统筹集成，突出重点。
　　四、发展目标
　　总体目标是：以《规划纲要》实施中的具体需求为导向，以提高自主创新能力和国际竞争力为核心，结合“十一五”科技发展计划，构建国家对外科技合作与交流平台，参与多边或双边重大科技合作计划，为贯彻落实《规划纲要》的各项任务、增强我国科技自主创新能力提供有力支撑，促进国内研发活动在重点领域的跨越式发展，提高我国国际科技声望和总体水平，形成一批国际科技合作研发基地，吸引海外人才参与国内经济建设与科技发展，同时为我国优秀科技人才走向国际舞台创造条件和机会。 　　到2010年，要达到以下具体目标：
　　1．配合和促进我国外交战略的实现及《规划纲要》的实施，落实双边、多边政府间科技合作协定，促进国际经济技术谈判和磋商；
　　2．积极参与国际大科学、大工程计划，超前部署以我为主的前瞻性大科学大工程合作计划，充分利用国际大科学计划和大科学工程平台，分享世界最新研究成果，加快提升我国自主创新能力，保持我国在若干重点领域的领先优势；
　　3．加强与发达国家的一流合作，解决关键技术瓶颈、重大科学问题，提高自主创新能力，在若干重点领域实现重点跨越；
　　4．引进和有效利用一批国际顶尖人才和关键技术，建立若干重点领域国际科技合作基地，为《规划纲要》实施提供人才和技术支撑；
　　5．形成一整套较为完善的国际科技合作与全球科技资源有效利用机制，大力提升我国科技的国际影响、国际地位，在全球性关键能源、资源利用等方面占据更重要的位置。
　　五、支持重点
　　1．紧密围绕《规划纲要》，以我为主，着力解决制约我国经济、科技发展的重大科学问题和关键技术瓶颈，有利于实现“重点跨越”的重大国际科技合作；
　　2．紧密结合国家外交战略，以科技合作为突破口，有助于打开外交局面，促进双边或多边科技、经济乃至政治谈判的重大国际科技合作；
　　3．紧密结合国家发展战略和国家安全，以国家利益为出发点，有利于我国抢占能源、资源、信息、技术等战略制高点，有利于将来海洋势力范围划分、资源利用中我国利益，为将来中国的国家权益和地位争取发言权的重大国际科技合作。